Parte IV

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Caratterizzazione citogenetica

Analisi del cariotipo delle varie accessioni locali di SNT
e delle varietà commerciali messe a confronto

Citogenetica molecolare: mappatura
genica mediante ibridazione in situ
fluorescente (FISH)
esempio di cariotipo del sedano
(11 coppie di cromosomi omologhi)

n. 6 accessioni locali SNT
n. 4 varietà commerciali
n. 2 specie affini (controllo)

 
Caratterizzazione molecolare del SNT (cultivar identification) attraverso l’analisi dei polimorfismi della lunghezza dei frammenti (di restrizione) amplificati : AFLP

Digestione-ligazione
Pre-amplificazione e amplificazione selettive
Analisi su gel di poliacrilammide
 

1. Protocollo di estrazione DNA;

2. Enzimi di restrizione;

3. Adattatori e primer;

4. Matrice coefficienti di similarità (UPGMA);

5. Albero filogenetico  (dendrogramma, NTSYS).

Immagine di analisi su gel di poliacrilamide